Разработка проблемы клещевого энцефалита проводится с позиций изучения структуры клинических вариантов данного заболевания в целях понимания общих механизмов формирования взаимоотношений вируса и человека и поиска наиболее надежных критериев дифференциального диагноза и прогноза вне рамок частной нозологической формы. В целях уточнения диагноза и прогноза впервые на модели клещевого энцефалита применена многофакторная система клинического анализа, предусматривающего учет наряду с симптомами острой фазы всего спектра проявлений общей болезни человека
Н.П.Толоконская, Э.А.Спиридонова, Ю.В.Казакова, Л.О.Черницына [138, 150, 151, 152].
Разработаны дифференциальнодиагностические критерии ранней фазы менингеальной и менингоэнцефалитической форм клещевого энцефалита. Выявлены ассоциации между определенным HLA-фенотипом и силой гуморального иммунного ответа на различные антигены вируса клещевого энцефалита: HLA-B12 ассоциирован с более интенсивной, HLA-А1, А3 – с менее интенсивной продукцией определенных изотипов иммуноглобулинов на антигены вируса клещевого энцефалита, что определяет более тяжелую форму заболевания. Предложено оценивать интенсивность иммунного ответа в динамике клещевого энцефалита по показателям продукции антител к NS1 и E-белкам вируса при различных клинических формах/